France Dufresne

Professeure agrégée,
Université du Québec à Rimouski

Département de Biologie
Courriel: France_dufresne@uqar.ca
Page web de l'institution




Éducation

Postdoctorat - Génétique des populations : 1999,Scripps Institute of Oceanography
Postdoctorat - Génétique des populations: 1998, Université Laval
Doctorat - Zoologie: 1995, University of Guelph
Maîtrise - Biologie:1990, Université Laval
Baccalauréat - Biologie de l'environnement: 1987, McGill University


Recherche

Les travaux dans mon laboratoire ont en commun d'intégrer différents niveaux d'organisation pour répondre à des questions en biologie évolutive. Mes travaux principaux s'orientent autour des aspects évolutifs liés à la polyploïdie chez les cladocères. Nous examinons les effets des duplications chromosomiques sur la physiologie et l'écologie des invertébrés d'eau douce. Grâce au séquençage du génome de la puce d’eau, Daphnia pulex, nous disposons de nouveaux outils pour caractériser les génomes. Ainsi, nous nous intéressons aux gènes qui contrôlent la taille corporelle chez les daphnies. Ce caractère est un des plus importants en biologie évolutive puisqu’il est lié à la valeur reproductive (fitness) et curieusement nous en connaissons très peu sur les gènes qui le contrôlent. Je m'intéresse également aux facteurs liés à l'origine et au maintien de l'asexualité. Pourquoi les organismes asexués affichent souvent une distribution géographique différente de leurs ancêtres sexués ? Des centaines de clones de daphnies se retrouvent dans les environnements vierges de l'arctique et servent à tester différentes hypothèse évolutives (niche congelée, génotype tout-usage). Les approches utilisées dans mon laboratoire pour répondre à ces questions comprennent une combinaison de techniques moléculaires (allozymes, microsatellites, SSCP, séquençage), des mesures métaboliques ainsi que des expériences.

Étudiants CSBQ

Marie-Hélène Armaly St-Gelais

M.Sc.
(Début: 2018, Fin: 2020)
Le rôle de l’épigénétique dans l’adaptation à la salinité chez le cladocère apomictique Daphnia pulex

Marie-Ève Labonté-Dupras

B.Sc.
(Début: 2017, Fin: 2019)
Étude des effets écologiques du polymorphisme de coloration chez le bruant à gorge blanche

Anciens étudiants (depuis 2009)

Philippe Boucher

Ph.D.
(Début: 2007, Fin: 2010)
Génomique écologique et adaptation à la température chez Daphnia pulex

Dominique Hamel

Ph.D.
Autre (co-)superviseur: André Rochon
(Début: 2004, Fin: 2010)
Diversité génétique chez Alexandrium tamarense de l'estuaire du Saint-Laurent

Adriana Radulovici

Ph.D.
(Début: 2006, Fin: 2012)
Barcoding et structure génétique des amphipodes marins

Geneviève Coté

M.Sc.
Autre (co-)superviseur: Rémy Rochette, Université du Nouveau-Brunswick à Saint-Jean
(Début: 2010, Fin: 2015)
ÉVALUATION DE LA BIODIVERSITÉ MARINE SUR SUBSTRAT ROCHEUX À L’AIDE DU CODEBARRE GÉNÉTIQUE ET INFLUENCE DE DEUX TYPES DE SUBSTRATS SUR LE RECRUTEMENT DES ESPÈCES ENDÉMIQUES ET DE L’ESPÈCE ALLOCHTONE CI

Jean-Michel Martin

M.Sc.
(Début: 2014, Fin: 2018)
Effet de la ploïdie et de l'exposition aux rayons UV sur la plasticité pigmentaire de Daphnia arctiques

Frédérique Paquin

M.Sc.
(Début: 2013, Fin: 2018)
Du génotype au phénotype: effets des contaminants métalliques sur l'accumulation de mutations et le métabolisme mitochondrial des Daphnia pulex

Thierry Ratté

M.Sc.
(Début: 2006, Fin: 2010)
Croissance et métabolisme à différentes températures en fonction de la ploïdie chez les daphnies

Gaëlle Van Dijk

M.Sc.
(Début: 2013, Fin: 2015)
Autre (co-)superviseur membre du CSBQ: Pierre Blier
Héritabilité de la capacité antioxydante chez les épinoches, Gasterosteus aculeatus

Exemples d'espèces étudiées

Daphnia pulex
Pyganodon
Bivalvia
Unionoida
Unionidae
Daphnia pulicaria
Pulex
Cladocera
Daphniidae
Daphnia magna
Salvelinus alpinus
Nereididae
Neanthes virens
Hediste diversicolor
Mytilus edulis
Hyalella azteca
Semibalanus balanoides
Nereis virens
Hyalella
Amphipoda
Mytilus trossulus
Salvelinus fontinalis


Publications

51- From Africa to Antarctica: Exploring the Metabolism of Fish Heart Mitochondria Across a Wide Thermal Range
Hunter-Manseau F , Desrosiers V , Le François N R , Dufresne F , Detrich H W , Nozais C , Blier P U ,
2019 Frontiers in Physiology (Date Added: 2019-11-06)

50- Sperm number assessed by flow cytometry in species of Daphnia (Crustacea, Cladocera)
Dufresne F , Belzile C , McKindsey C , Beaudreau N ,
2019 Invertebrate Biology (Date Added: 2019-09-02)

49- Age dependent dysfunction of mitochondrial and ROS metabolism induced by mitonuclear mismatch
Pichaud N , Bérubé R , Côté G , Belzile C , Dufresne F , Morrow G , Tanguay R M , Rand D M , Blier P U ,
2019 Frontiers in Genetics (Date Added: 2019-05-31)

48- Hybridization between char species (Salvelinus alpinus and Salvelinus fontinalis): A fast track for novel allometric trajectories
Dupont Cyr B , Dufresne F , Christen F , Desrosiers V , Proulx ,
2018 Biology Open (Date Added: 2018-11-04)

47- Species identification and connectivity of marine amphipods in Canada’s three oceans
Tempestini A , Rysgaard S , Dufresne F ,
2018 PLoS ONE (Date Added: 2018-06-09)

46- Mytilus trossulus and hybrid (M. edulis-M. trossulus) – New hosts organisms for pathogenic microalgae Coccomyxa sp. from the Estuary and northwestern Gulf of St. Lawrence, Canada
Zuykov M , Anderson J , Archambault P , Dufresne F , Pelletier E ,
2018 Journal of Invertebrate Pathology (Date Added: 2018-03-28)

45- Thermal tolerance and thermal sensitivity of heart mitochondria: Mitochondrial integrity and ROS production
Christen F , Desrosiers V , Dupont-Cyr B A , Vandenberg G W , Le François N R , Tardif J , Dufresne F , Lamarre S G , Blier P U ,
2018 Free Radical Biology and Medicine (Date Added: 2018-01-19)

44- Molecular phylogeny of the genus Themisto (GuCrossed D sign©rin, 1925) (Amphipoda: Hyperiidae) in the Northern Hemisphere
Tempestini A , Fortier L , Pinchuk A , Dufresne F ,
2017 Journal of Crustacean Biology (Date Added: 2018-01-19)

43- Temperature-related differences in mitochondrial function among clones of the cladoceran Daphnia pulex
Kake-Guena S , Touisse K , Warren B , Scott K , Dufresne F , Blier P , Lemieux H ,
2017 Journal of Thermal Biology (Date Added: 2017-06-24)

42- Eicosapentaenoic acid monoglyceride resolves inflammation in an ex vivo model of human peripheral blood mononuclear cell
Morin C , Charbonneau L , Ouellet N , Ouellet H , Blier P U , Dufresne F , Fortin S ,
2017 European Journal of Pharmacology (Date Added: 2017-06-08)

41- Association between clonal diversity and species diversity in subarctic zooplankton communities
Dionne K , Jose C , Caron A , Dufresne F ,
2017 Journal of Plankton Research (Date Added: 2017-04-17)

40- Overlapping trophic niches among co-occurring amphipods from a cryptic species complex
Dionne K , Dufresne F , Nozais C ,
2017 Freshwater Biology (Date Added: 2017-04-12)

39- Variation in δ13C and δ15N trophic enrichment factors among Hyalella azteca amphipods from different lakes
Dionne, K, Dufresne, F, Nozais, C
2016 Hydrobiologia (Date Added: 2016-08-01)

38- Don't throw the baby out with the bathwater: identifying and mapping paralogs in salmonids
Dufresne, F
2016 Molecular Ecology Resources (Date Added: 2016-02-01)

36- Assessment of mitochondrial functions in Daphnia pulex clones using high-resolution respirometry
Kake-Guena, SA, Touisse, K, Vergilino, R, Dufresne, F, Blier, PU, Lemieux, H
2015 Journal of Experimental Zoology. Part A, Ecological Genetics and Physiology (Date Added: 2015-07-10)

35- Climate Effects on High Latitude Daphnia via Food Quality and Thresholds
Przytulska, A, Bartosiewicz, M, Rautio, M, Dufresne, F, Vincent, WF
2015 PloS one (Date Added: 2015-06-01)

34- Impact of ploidy level on the distribution of Pokey element insertions in the Daphnia pulex complex
Vergilino, R, Eagle, SH, Crease, TJ, Dufresne, F
2014 Mobile DNA (Date Added: 2014-08-21)

33- First record of the green microalgae Coccomyxa sp. in blue mussel Mytilus edulis (L.) from the Lower St. Lawrence Estuary (Québec, Canada)
Zuykov, M, Belzile, C, Lemaire, N, Gosselin, M, Dufresne, F, Pelletier, E
2014 Journal of Invertebrate Pathology (Date Added: 2014-08-21)

31- Evolution of a transposon in Daphnia hybrid genomes
Vergilino, R
2013 MOBILE DNA (Date Added: 2016-06-22)

29- Genome size differences in Hyalella cryptic species
Vergilino, R, Dionne, K, Nozais, C, Dufresne, F, Belzile, C
2012 Genome / National Research Council Canada = Genome / Conseil National de Recherches Canada (Date Added: 2016-07-11)

28- Pyganodon (Bivalvia: Unionoida: Unionidae) phylogenetics: a male- and female-transmitted mitochondrial DNA perspective
Doucet-Beaupré, H, Blier, PU, Chapman, EG, Piontkivska, H, Dufresne, F, Sietman, BE, Mulcrone, RS, Hoeh, WR
2012 Molecular phylogenetics and evolution (Date Added: 2012-07-04)

27- No evidence for temporal variation in a Cryptic species community of freshwater amphipods of the Hyalella azteca species complex
Dionne, K, Vergilino, R, Dufresne, F, Charles, F, Nozais, C
2011 Diversity (Date Added: 2015-02-19)

26- The History of the Daphnia Pulex complex: Asexuality, Hybridization, And Polyploidy
Dufresne,
2011 Phylogeography and population genetics in Crustacea (Date Added: 2012-09-15)

25- Diversity in the Reproductive Modes of European Daphnia pulicaria Deviates from the Geographical Parthenogenesis
Dufresne, F, Marková, S, Vergilino, R, Ventura, M, Kotlík, P
2011 PLoS ONE (Date Added: 2012-07-04)

24- Spatial variation in food availability predicts extrapair paternity in the arctic fox
Cameron, C, Berteaux, D, Dufresne, F
2011 Behavioral Ecology (Date Added: 2012-07-04)

23- DNA Barcodes for Marine Biodiversity: Moving Fast Forward?
Radulovici, AE, Archambault, P, Dufresne, F
2010 Diversity (Date Added: 2012-07-04)

22- Unusual duplication of the insulin-like receptor in the crustacean Daphnia pulex
Boucher, P, Ditlecadet, D, Dubé, C, Dufresne, F
2010 BMC Evolutionary Biology (Date Added: 2012-07-04)

20- DNA barcoding of marine crustaceans from the Estuary and Gulf of St Lawrence: a regional-scale approach
Radulovici, AE, Sainte-Marie, B, Dufresne, F
2009 Molecular ecology resources (Date Added: 2012-07-04)

19- Genome size evolution and polyploidy in the Daphnia pulex complex (Cladocera: Daphniidae)
Vergilino, R, Belzile, C, Dufresne, F
2009 Biological Journal of the Linnean Society (Date Added: 2012-07-04)

18- Low flexibility of metabolic capacity in subarctic and temperate cytotypes of Daphnia pulex
Jose, C, Chatelain, H, Dufresne, F
2009 Journal of Thermal Biology (Date Added: 2012-07-04)

17- Do territorial male three-spined sticklebacks have sperm with different characteristics than nonterritorial males?
Côté, J, Blier, PU, Caron, A, Dufresne, F
2009 Canadian Journal of Zoology (Date Added: 2012-05-10)

16- Digestive capacities, inbreeding and growth capacities in juvenile Arctic charr Salvelinus alpinus
Ditlecadet, D, Blier, PU, Le François, NR, Dufresne, F
2009 Journal of Fish Biology (Date Added: 2012-05-10)

15- Plasticity of growth rate and metabolism in Daphnia magna populations from different thermal habitats
Chopelet, J, Blier, Pu, Dufresne, F
2008 Journal of Experimental Zoology Part A: Ecological Genetics and Physiology (Date Added: 2012-07-24)

14- Large genomes among caridean shrimp
Rees, DJ, Belzile, C, Glémet, H, Dufresne, F
2008 Genome / National Research Council Canada = Génome / Conseil national de recherches Canada (Date Added: 2012-07-04)

13- Cryptic intercontinental colonization in water fleas Daphnia pulicaria inferred from phylogenetic analysis of mitochondrial DNA variation
Marková, S, Dufresne, F, Rees, DJ, ?erný, M, Kotlík, P
2007 Molecular Phylogenetics and Evolution (Date Added: 2012-07-24)

12- Amphipod genome sizes: first estimates for Arctic species reveal genomic giants
Rees, DJ, Dufresne, F, Glémet, H, Belzile, C
2007 Genome (Date Added: 2012-07-24)

11- Applying microsatellites in two commercial strains of Arctic charr (Salvelinus alpinus): Potential for a selective breeding program
Ditlecadet, D, Dufresne, F, Le François, NR, Blier, PU
2006 Aquaculture (Date Added: 2012-07-24)

10- Morphological variation in Nereis (Neanthes) virens (Polychaeta: Nereididae) populations
Breton, S, Dufresne, F, Desrosiers, G, Blier, P
2004 Journal of the Marine Biological Association of the United Kingdom (Date Added: 2014-02-19)

7- Natural selection and the evolution of mtDNA-encoded peptides: evidence for intergenomic co-adaptation
Blier, PU, Dufresne, F, Burton, RS
2001 Trends in Genetics (Date Added: 2012-07-24)

6- Isolation and characterization of microsatellite markers in the acorn barnacle Semibalanus balanoides
Dufresne, F, Parent, M, Bernatchez, L
1999 Molecular Ecology (Date Added: 2012-07-24)

5- Pleistocene glaciations and polyphyletic origins of polyploidy in an arctic cladoceran
Dufresne, F, Hebert, PDN
1997 Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences (Date Added: 2012-07-24)

4- Metabolism and habitat competition in the polychaete Nereis virens
Lemieux, H, Blier, PU, Dufresne, F, Desrosiers, G
1997 Marine Ecology Progress Series (Date Added: 2012-05-10)

3- Polyploidy and clonal diversity in an arctic cladoceran
Dufresne, F, Hebert, P
1995 Heredity (Date Added: 2012-07-24)

2- Hybridization and Origins of Polyploidy
Dufresne, F, Hebert, PDN
1994 Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences (Date Added: 2012-07-24)

1- Atomic models for the polypeptide backbones of myohemerythrin and hemerythrin
Hendrickson, WA, Ward, KB
1975 Biochemical and Biophysical Research Communications (Date Added: 2014-08-21)