Geneviève Coté
Université du Québec à Rimouski
Candidat M.Sc.
superviseur(e): France Dufresne
Rémy Rochette, Université du Nouveau-Brunswick à Saint-Jean
Début: 2010-09-01
Fin: 2015-09-30
Candidat M.Sc.
superviseur(e): France Dufresne
Rémy Rochette, Université du Nouveau-Brunswick à Saint-Jean
Début: 2010-09-01
Fin: 2015-09-30
Projet
ÉVALUATION DE LA BIODIVERSITÉ MARINE SUR SUBSTRAT ROCHEUX À L’AIDE DU CODEBARRE GÉNÉTIQUE ET INFLUENCE DE DEUX TYPES DE SUBSTRATS SUR LE RECRUTEMENT DES ESPÈCES ENDÉMIQUES ET DE L’ESPÈCE ALLOCHTONE CIDans les dernières décennies, l'intérêt porté à la conservation de la biodiversité mondiale a considérablement augmenté en raison de nombreuses contraintes affectant la structure des communautés (y compris les extinctions) et l'abondance des espèces. En milieu marin, l'une des menaces les plus importantes pour la biodiversité est l'introduction d'espèces envahissantes. Un programme de monitorage de la biodiversité a récemment été mis en place afin d'effectuer un suivi de la biodiversité de quatre régions du sud-ouest de la Baie de Fundy, récemment identifiées comme des Zones d’Importance Écologique et Biologique. Dans le cadre de ce programme, nous avons testé l'utilisation de "collecteurs" pour surveiller la biodiversité des invertébrés marins colonisant les substrats rocheux dans les eaux peu profondes de la zone subtidale. Dans cette étude, nous nous sommes penché sur deux objectifs: 1) la caractérisation de la biodiversité des invertébrés colonisant les collecteurs (les « settlers » et les « crawl-ins ») avec la technique du codebarre génétique et 2) la comparaison du recrutement des espèces endémiques, ainsi que l'espèce envahissante Ciona instestinalis sur des galets naturellement colonisée dans le bas intertidal et des galets de carrière dénudés d’organismes. Pour le deuxième objectif, 16 collecteurs remplis de galets ont été immergés dans la zone subtidale peu profonde à Beaver Harbour, dont 8 représentaient le substrat artificiel et 8 autres le substrat naturel. Des analyses multivariées ont été effectuées et démontrent un effet significatif du type de substrat sur la structure des communautés lorsque les données non transformées ont été analysés (Global R = 0,366, p = 0,001) mais aucun effet du type de substrat lorsque l'analyse a été menée à partir d’une matrice de données présence / absence (Global R = 0,127 ; p = 0,074), indiquant que le type de substrat affecte l'abondance des espèces retrouvées dans les collecteurs, mais pas leur identité. Par la suite, une analyse de variance (ANOVA) a démontré une plus grande abondance de l'ascidie Ciona intestinalis dans les cages remplies de roches de carrière par rapport aux cages garnies de galets de la zone intertidale (F (1,15) = 21,85; p: 0,0004). La caractérisation génétique des spécimens (70 espèces) a été réalisée dans un « hotspot » de biodiversité connue du sud-ouest de la baie de Fundy, soit le site The Wolve. L'ADN de la région conservée du gène CO1 (ou 18S lors d’échec d’amplification du gène CO1) de plus de 50 espèces a pu être amplifié en utilisant un total de 30 amorces. Le succès de séquençage total était de 66,6%, une grande concordance entre les identifications des espèces fait sur les bases génétiques et de la morphologie a été notée, bien que nous ayons décelé un certain manque pour les cnidaires (faibles taux d'évolution des mitochondries) et pour certains individus très jeunes.
