Projet
Succession microbienne et activité biogéochimique dans les écosystèmes en déglaciationLorsque les glaciers des régions arctiques reculent en raison du changement climatique en cours, ils exposent de nouvelles zones étendues de sol pauvre en nutriments. Ces "sols pionniers", qui ont été piégés sous la glace et dépourvus de vie pendant des milliers d'années, sont rapidement colonisés par des micro-organismes qui commencent à préparer le paysage à accueillir un nouvel écosystème de plantes et d'animaux. Il est important de comprendre comment la vie se développe dans les sols pionniers pour appréhender l'avenir des écosystèmes arctiques et du climat mondial. Dans mon étude, j'évaluerai la façon dont les micro-organismes colonisent les sols pionniers en prélevant des échantillons de sols d'âges différents (5-200 ans) devant des glaciers en recul dans le Haut-Arctique canadien et en Antarctique. Chaque sol sera examiné à l'aide de diverses techniques conçues pour analyser l'activité microbienne à l'échelle de la cellule unique et de la communauté. Les analyses unicellulaires fourniront des informations sur l'endroit où les cellules et les espèces bactériennes individuelles vivent dans le sol et sur les activités métaboliques qu'elles réalisent, tandis que les analyses au niveau de la communauté fourniront des informations sur la manière dont l'activité unicellulaire est liée à la performance de la communauté entière dans le contexte des cycles globaux des nutriments. En évaluant des sols pionniers d'âges multiples, à deux périodes différentes de l'année et à plusieurs échelles biologiques, je dresserai un portrait dynamique de la manière dont un sol initialement sans vie peut finalement devenir une riche communauté biologique.
Mots-clés
biogeochemistry, microbial ecology, environmental microbiology, microbial succession, glacier forefield, climate changePublications
1- An altered microbiome in urban coyotes mediates relationships between anthropogenic diet and poor healthSugden, Scott, Dana Sanderson, Kyra Ford, Lisa Y. Stein, Colleen Cassady St. Clair
2020 Scientific Reports
2- Individual and Site-Specific Variation in a Biogeographical Profile of the Coyote Gastrointestinal Microbiota
Sugden, Scott, Colleen Cassady St. Clair, Lisa Y. Stein
2020 Microbial Ecology
3- Metabolome profiles of the alphaproteobacterial methanotroph Methylocystis sp. Rockwell in response to carbon and nitrogen source
Lazic, Marina, Scott Sugden, Dominic Sauvageau, Lisa Y Stein
2021 FEMS Microbiology Letters
4- Transcriptomic and Metabolomic Responses to Carbon and Nitrogen Sources in Methylomicrobium album BG8
Sugden, Scott, Marina Lazic, Dominic Sauvageau, Lisa Y. Stein,
2021 Applied and Environmental Microbiology
5- Nutritional and ecological perspectives of the interrelationships between diet and the gut microbiome in multiple sclerosis: Insights from marmosets
Perez-Muñoz, Maria Elisa, Scott Sugden, Hermie J.M. Harmsen, Bert A. ‘t Hart, Jon D. Laman, Jens Walter
2021 iScience
6- Inter-population differences in coyote diet and niche width along an urban–suburban–rural gradient
Sugden, Scott, Maureen Murray, Mark A Edwards, Colleen Cassady St. Clair
2021 Journal of Urban Ecology
7- Microbiome of the freshwater sponge Ephydatia muelleri shares compositional and functional similarities with those of marine sponges
Sugden, Scott, Johannes Holert, Erick Cardenas, William W Mohn, Lisa Y Stein
2022 The ISME Journal
8- A ten-year community reporting database reveals rising coyote boldness and associated human concern in Edmonton, Canada
Farr, Jonathan, Matthew Pruden, Robin Glover, Maureen Murray, Scott Sugden, Howard Harshaw, Colleen Cassady St. Clair
2023 Ecology and Society
9- Age-dependent relationships among diet, body condition, and Echinococcus multilocularis infection in urban coyotes
Scott Sugden, Deanna K. Steckler, Dana Sanderson, Bill Abercrombie, Duncan Abercrombie, M. Alexis Seguin, Kyra Ford, Colleen Cassady St. Clair
2023 PLOS ONE
