INRS
Candidat Postdoctoral fellow
superviseur(e): Etienne Yergeau
Début: 2024-07-01
Fin: 2025-02-21
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Projet

Synergies de bactéries phytobénéfiques et interactions avec le microbiote de la rhizosphère de la laitue dans un contexte de contrôle d’une maladie fongique
Ce projet de recherche explore les synergies entre des bactéries phytobénéfiques des genres Pseudomonas et Bacillus et leur interaction avec différents microbiotes du sol pour contrôler le champignon pathogène Sclerotinia sclerotiorum, responsable de la sclérotiniose chez la laitue. Cette maladie entraîne des pertes importantes dans la production de laitue et d’autres cultures d’importance économique, telles que le canola. Présentement, les pesticides de synthèse sont la méthode principale de lutte, mais ils posent des problèmes de résistance et d'impact environnemental. Le projet vise à identifier des combinaisons bactériennes synergiques capables d'inhiber ce champignon de manière plus efficace que les pesticides actuels. Il a également pour but d’étudier le rôle de la structure des communautés microbienne du sol dans l’installation des bactéries phytobénéfiques et dans leur capacité à contrôler le champignon. Ce projet allie des techniques classiques de microbiologie et de biologie moléculaire à une large palette d’outils de séquençage de nouvelle génération, de méthodes d’analyses bioinformatiques et de modélisation. Il contribuera au développement de biopesticides plus performants et durables, améliorant la protection des cultures tout en réduisant l'usage de pesticides de synthèse.

Mots-clés

Pseudomonas, Bacillus, Communautés microbiennes, Microbiote, Sclerotinia, Laitue, Microbial community, Microbiome, Lettuce, microbiology, microbiologie, Biopesticides, Biocontrol, Biocontrôle, pgpr

Publications

1- Density-dependent dispersal in biological control agents: a reflexion on the side-effects of mass-rearing conditions
Zboralski, Antoine, Marine Vilarelle, Etty Colombel, Elisabeth Tabone, Elodie Vercken
2015 BioControl

2- Metabolic and Genomic Traits of Phytobeneficial Phenazine-ProducingPseudomonasspp. Are Linked to Rhizosphere Colonization inArabidopsis thalianaandSolanum tuberosum
Zboralski, Antoine, Adrien Biessy, Marie-Claude Savoie, Amy Novinscak, Martin Filion,
2020 Applied and Environmental Microbiology

3- Genetic factors involved in rhizosphere colonization by phytobeneficial Pseudomonas spp.
Zboralski, Antoine, Martin Filion
2020 Computational and Structural Biotechnology Journal

4- Inhibition of Three Potato Pathogens by Phenazine-Producing Pseudomonas spp. Is Associated with Multiple Biocontrol-Related Traits
Biessy, Adrien, Amy Novinscak, Renée St-Onge, Geneviève Léger, Antoine Zboralski, Martin Filion,
2021 mSphere

5- Bridging the Gap: Type III Secretion Systems in Plant-Beneficial Bacteria
Zboralski, Antoine, Adrien Biessy, Martin Filion
2022 Microorganisms

6- Interplay between Arabidopsis thaliana Genotype, Plant Growth and Rhizosphere Colonization by Phytobeneficial Phenazine-Producing Pseudomonas chlororaphis
Zboralski, Antoine, Hara Saadia, Amy Novinscak, Martin Filion
2022 Microorganisms

7- Harnessing the genomic diversity of Pseudomonas strains against lettuce bacterial pathogens
Zboralski, Antoine, Adrien Biessy, Marie Ciotola, Mélanie Cadieux, Daphné Albert, Jochen Blom, Martin Filion
2022 Frontiers in Microbiology

8- Genome exploration and ecological competence are key to developing effective Pseudomonas-based biocontrol inoculants
Zboralski, Antoine, Adrien Biessy, Martin Filion
2023 Canadian Journal of Plant Pathology

9- Pseudomonas spp. can help plants face climate change
Zboralski, Antoine, Martin Filion
2023 Frontiers in Microbiology

10- Identification and genomic characterization of Pseudomonas spp. displaying biocontrol activity against Sclerotinia sclerotiorum in lettuce
Albert, Daphné, Antoine Zboralski, Marie Ciotola, Mélanie Cadieux, Adrien Biessy, Jochen Blom, Carole Beaulieu, Martin Filion
2024 Frontiers in Microbiology