Judith Mogouong
Projet
Modulation des communautés microbiennes associées à un hôte sous l’influence des stress biotiques et abiotiquesL’agrile du frêne est un insecte ravageur s’alimentant dans le phloème et causant d’importants dommages à toutes les essences de frênes présentes en Amérique du Nord. Les insectes sont connus comme étant des vecteurs d’une communauté microbienne pouvant leur permettre de survivre et de s’adapter à leur environnement. La structure de cette communauté microbienne symbiotique peut être influencée par plusieurs facteurs. D’une part les variables environnementales peuvent être responsables des structures spatiales de l’assemblage d’espèces (contrôle abiotique) et d’autre part, ces structures spatiales peuvent aussi être générées par les autocorrélations dans les structures (contrôle biotique). L’objectif du projet était de mettre en évidence la dynamique des communautés microbiennes associées au tract intestinal de l’agrile du frêne face au facteur de densité de populations d’insectes. Pour ce faire, un échantillonnage a été effectué sur des arbres ayant des niveaux d’infestations variés (endémiques à épidémiques). Des données ont été générées à partir du séquençage d’extraits d’ADN du tract intestinal des insectes (Illumina MiSeq). Le traitement des données avec des outils bioinformatiques a permis de générer des Unités Taxonomiques Opérationnelles (OTU) pour réaliser des analyses quantitatives multidimensionnelles avec le logiciel R. Des éléments de la dynamique des communautés microbiennes que représentent ces espèces d’OTU associées à l’insecte ont été mis en évidence. Ainsi, on a pu analyser les interactions entre les indices de diversité et la densité des insectes dans l’arbre, les corrélations entre la densité de l’insecte et des facteurs spécifiques des arbres hôtes. Cette étude apporte des informations essentielles dans la compréhension de la dynamique des communautés microbiennes associées à l’insecte sous l’influence de pressions externes. Elle ouvre des perspectives intéressantes dans un contexte de développement d’outils de lutte biologique.
Mots-clés
Microbiome, Emerald ash borer, disturbance, Gut, Beta diversity, Alpha diversity, recruitment, Population density, Molecular indicator, Core, Bacterial community, Fungal communityPublications
1- The phyllosphere microbiome of host trees contributes more than leaf phytochemicals to variation in the Agrilus planipennis Fairmaire gut microbiome structureMogouong, Judith, Philippe Constant, Pierre Legendre, Claude Guertin
2021 Scientific Reports
2- Gut microbiome of the emerald ash borer, Agrilus planipennis Fairmaire, and its relationship with insect population density
Guertin, Claude, Robert Lavallée, Philippe Constant, Judith Mogouong
2020 FEMS Microbiology Ecology
