Université du Québec à Montréal
Candidat Ph.D.
superviseur(e): Steven Kembel
Vicky Toussaint, Agriculture et Agroalimentaire Canada
Début: 2016-01-04
Fin: 2021-01-04

Projet

Étude de la diversité du microbiome de la phylosphère de cucurbitacées en condition de culture de couverture
Cette étude vise à appréhender les processus et dynamiques de diversité des communautés de microorganismes de cucurbitacées en condition de culture de couverture de seigle vs plastique. 1- Étude de dynamique spatiale et temporelle de la diversité du microbiome de la courge par approche amplicons 16s 2- Dresser un profil de la microbiologie par approche en culture cellulaire 3- Évaluation d'adaptation génétique environnemental par analyse de génomique des population de microogranismes par étude métagénomique en shotgun. 4- Optimisation des analyses métagénomique par approche de séquençage Hi-C (chromosome capture)

Mots-clés

Microbiome, community ecology, agricultural systems, Biodiversity and ecosystem functioning, high throughput sequencing