Université du Québec à Montréal
Candidat Ph.D.
superviseur(e): Steven Kembel
Christian Messier, Université du Québec à Montréal
Début: 2012-09-01
Fin: 2017-01-14
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Projet

Communautés bactériennes de la phyllosphère de la forêt tempérée naturelle et urbaine du Québec
Bactéries et champignons colonisent presque tous les tissus et surfaces des arbres, des racines (rhizosphère) aux feuilles (phyllosphère). La diversité de ces communautés contrôle plusieurs fonctions écosystémiques de par l’implication des microorganismes dans de multiples processus enzymatiques (nutritionnel, biochimique et anti-pathogène) des individus arborescents. Les microorganismes possèdent un ratio surface/volume élevé, une croissance rapide et un temps de génération court, ce qui leur permet de réagir rapidement aux modifications environnementales. Tout changement dans la masse, l’activité métabolique ou la structure des communautés microbiennes pourrait donc être considéré comme le début d’un changement global au niveau de l’écosystème. Depuis le début des années 2000, les études microbiennes ont subi une révolution majeure lors du développement des techniques de séquençage à haut débit, ce qui a libéré les chercheurs des méthodes nécessitant la culture des microorganismes. Ces méthodes ont longtemps limité la profondeur et la qualité des recensements microbiens, et donc la qualité des recherches scientifiques sur le sujet. Alors que plusieurs études se sont intéressées au rôle des communautés microbiennes du sol sur la croissance et survie des arbres, très peu de connaissances ont été acquises concernant le rôle des communautés microbiennes habitant les surfaces aériennes (tronc et feuilles) dans la dynamique des écosystèmes forestiers. Récemment, plusieurs recherches démontrent cependant la haute complexité de ces communautés et laissent présager qu’elles pourraient jouer un rôle déterminant pour la santé des arbres en milieux naturels et urbains. Le but de ce projet est donc d’acquérir les connaissances nécessaires à la compréhension des processus dirigeant la dynamique des communautés microbiennes de la phyllosphère dans la forêt tempérée du Québec.

Mots-clés

Écologie des communautés, Biodiversité, bactéries

Publications

1- Present forest management structures and policies in temperate forests of Mexico: Challenges and prospects for unique tree species assemblages
Wallace, Jessica, Núria Aquilué, Chelsea Archambault, Sophie Carpentier, Xavier Francoeur, Marie-Hélène Greffard, Isabelle Laforest, Leopoldo Galicia, Christian Messier
2015 The Forestry Chronicle

2- Intraspecific variability in functional traits matters: case study of Scots pine
Laforest-Lapointe, Isabelle, Jordi Martínez-Vilalta, Javier Retana
2014 Oecologia