bachir iffis

Université de Montréal
Candidat Ph.D.
superviseur(e): Mohamed Hijri
Marc St-Arnaud
Début: 2012-09-05
Fin: 2017-01-05

Projet

Étude de la biodiversité microbienne associée aux champignons mycorhiziens arbusculaires dans des sites hautement contaminés par des hydrocarbures pétroliers
Les champignons mycorhiziens à arbuscules (CMA) sont des biotrophes obligatoires formant des associations symbiotiques avec des racines de plantes. Plusieurs études ont démontré que ces champignons jouent un rôle important dans la protection des plantes contre les pathogènes et contre les polluants organiques et inorganiques du sol. Cependant, dans un environnement complexe comme le sol, l’association entre les CMA et les plantes ne dépend pas uniquement des deux partenaires CMA-plantes. Plusieurs études ont montré que les CMA hébergent une large communauté de micro-organismes (MO) aussi bien en surface qu'à l'intérieur de leurs spores et mycéliums. La biodiversité et le(s) rôle(s) de ces MO demeurent toujours très peu connus, notamment pour les CMA collectés dans des sites contaminés. Ainsi, mon projet de doctorat a comme principal objectif l'étude de la biodiversité microbienne associée aux CMA collectés sur un site hautement contaminé par les hydrocarbures pétroliers. À cet effet, j'ai utilisé comme modèle d’étude des spores des CMA collectée à partir des échantillons des sols et des racines de plantes collectés dans les bassins de décantation des résidus pétroliers de l’ancienne raffinerie pétrochimique de Varennes à Montréal. Les objectifs de mon projet sont: (i) étudier la biodiversité des MO associées aux spores des CMA à des niveaux de contamination différents, (ii) étudier la biodiversité des MO associées aux CMA selon différentes espèces de plantes (iii) faire une étude comparative basée sur des modèles statistiques pour comprendre comment la diversité de ces MO est répartis selon les niveaux de contaminations et de types de plantes. - La méthodologie:Clonage, séquençage, séquençage à haut débit, analyses bioinformatiques et biostatistiques.