Project
Identification dans des sols agricoles de marqueurs microbiens corrélée à la dynamique de l’azoteEn raison de l’importance de l’azote pour les plantes, plusieurs études agricoles tentent de déterminer la dose optimale économique d’azote (DOEA) à fournir sous forme d’engrais. Il a été établi que sept facteurs agronomiques importants covarient avec la DOEA et expliquent jusqu’à 80 % de sa variation. Sachant qu’il a été possible de prédire la production et la qualité d’une récolte de blé uniquement à partir de la structure du microbiote au printemps, il devrait être possible d’identifier des variables microbiennes déterminantes associées à la DOEA afin de renforcer le modèle. L’hypothèse de ce projet est qu’il devrait être possible de corréler la structure de la communauté microbienne du sol ainsi que l’abondance et la diversité de certains gènes impliqués dans le cycle de l’azote à la dynamique de l’azote dans le sol. Trente-quatre fermes le long du fleuve Saint-Laurent utilisant une rotation soya-maïs répartie en sept régions administratives et trois pratiques de régénération seront échantillonnées. Pour chaque ferme, les analyses se feront sur trois répétitions d’un échantillon composite de cinq blocs recevant des doses de fertilisants azotés post-émergence (0, 50, 100, 150, 200 kg-N ha-1). Des plants seront récoltés à la fin de la saison afin de calculer le rendement. La caractérisation taxonomique du microbiome du sol par séquençage d’amplicons permettra de connaître la diversité et l’abondance des micro-organismes impliqués dans les processus de minéralisation, nitrification et dénitrification. De plus, la quantité et la diversité de gènes important dans le cyclage de l’azote (npr, amoA microbien et archée, nirK, nosZ) seront déterminées par séquençage et ddPCR.
