Rebecca Garner

Concordia University
Candidat M.Sc.

superviseur(e): Irene Gregory-Eaves
David Walsh, Concordia University
Début: 2018-01-01


Projet

La paléogénétique comparative des sédiments préindustriels et contemporains de lacs canadiens
Le Canada gère un nombre substantiel de lacs qui contribuent intégralement à la santé environnementale et qui sont vulnérables à plusieurs menaces anthropiques. Pour évaluer comment les perturbations humaines ont modifié la santé des lacs canadiens depuis leur état préindustriel, ce projet vise à reconstruire les anciennes communautés microbiennes des lacs et à les comparer à leurs assemblages contemporains. À l'aide de la nouvelle approche paléogénétique, l'ADN conservé dans les sédiments lacustres est récupéré pour reconstruire les communautés écologiques entières à une haute résolution de classification. L'ADN extrait des carottes de sédiments recueillies à travers le Canada par le Réseau LakePulse est séquencé et analysé pour évaluer comment les communautés microbiennes lacustres ont changé en réponse à l'impact humain. Cette étude représente la toute première tentative de mise en œuvre par l'approche paléogénétique pour reconstruire les paléocommunautés à l'échelle du paysage et pourrait permettre de découvrir des indicateurs sur la santé des lacs basés sur l'ADN. Cette recherche souligne le rôle du Canada en tant que gardien des eaux intérieures et le besoin de protéger cette ressource précieuse.

Mots-clés

Paleolimnology, paleogenetics, bioinformatics, computational biology, molecular biology, metagenomics, microbial ecology