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biome [2018/12/31 11:03]
alexcarter
biome [2018/12/31 11:23] (current)
alexcarter
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 [Fr] Cet atelier de 3 jours offert par le CBSQ vous permettra d'​apprendre les analyses bioinformatiques nécessaires pour votre projet d'ADN environnemental et de metabarcoding. L'​atelier sera dirigé par un conférencier invité - Benjamin Callahan professeur à la North Carolina State University (https://​callahanlab.cvm.ncsu.edu/​),​ et se concentrera sur les modules DADA2 (https://​benjjneb.github.io/​dada2/​index.html) et Phyloseq (https://​joey711.github.io/​phyloseq/​) dans R. [Fr] Cet atelier de 3 jours offert par le CBSQ vous permettra d'​apprendre les analyses bioinformatiques nécessaires pour votre projet d'ADN environnemental et de metabarcoding. L'​atelier sera dirigé par un conférencier invité - Benjamin Callahan professeur à la North Carolina State University (https://​callahanlab.cvm.ncsu.edu/​),​ et se concentrera sur les modules DADA2 (https://​benjjneb.github.io/​dada2/​index.html) et Phyloseq (https://​joey711.github.io/​phyloseq/​) dans R.
  
-{{ :​biome3_poster.pdf |}}+== Poster == 
 +{{ :​biome3_poster.pdf | Link}}
  
 +== Lectures and R labs ==
 +{{ :​lecture7_reproducibility.pdf |}}
 +{{ :​lecture_deseq2.pdf |}}
 +{{ :​lecture6_normlization_alphadiversity.pdf |}}
 +{{ :​lecture6a_distances_ordination.pdf |}}
 +{{ :​lecture1_exactasvs.pdf |}}
 +{{ :​lecture2_dada2_method.pdf |}}
 +{{ :​lab1_dada2tutorial.pdf |}}
 +{{ :​lab2_dada2tutorial.pdf |}}
 +{{ :​lecture0_metabarcoding_intro.pdf |}}
 +
 +== For more information and details == 
 +See the website created for the workshop https://​alexiscarter.github.io/​BIOME/​ , if you want to follow (or redo) more easily the workshop you can download or clone the GitHub repository at https://​github.com/​alexiscarter/​BIOME