Biodiversity Workshops



Introduction à la géostatistique avec R


05:00 pm, Tuesday 21 May 2013 - Tuesday 21 May 2013, Édifice Stewart-Biology de l’Université McGill (local N4/17).
Cet atelier d’une durée de 4 heures offre une introduction aux méthodes géostatistiques avec R. Les méthodes géostatistiques offrent de nombreuses possibilités pour la caractérisation de la stucture spatiale des variables, la création de cartes continues à partir de données ponctuelles (interpolation), la simulation de patrons spatiaux, l’analyse spatiale multivariée, ainsi que la prise en compte de l’autocorrélation spatiale dans les tests statistiques. L’atelier sera divisé en sections pratiques intercalées de présentations orales de l’instructeur. Nous encourageons les participants à utiliser leur propre ordinateur portable, mais des ordinateurs seront aussi disponibles sur place. Notez qu’une connaissance de base de R est nécessaire pour participer à cet atelier.





Introduction to geostatistics with R


05:00 pm, Tuesday 28 May 2013 - Tuesday 28 May 2013, Stewart-Biology building, McGill University (room N4/17).
This 4-hour workshop offers an introduction to geostatistical methods with R. Geostatistics offer numerous possibilities to characterize the spatial structure of variables, to create continous maps from point data (interpolation), to simulate spatial patterns, for multivariate analysis and for correcting for the effect of autocorrelation in statistical tests. This workshop will be divided in practical sections and oral presentations by the instructor. Participants are encouraged to use their own laptops but computers will be available on the site with the R software. The main R package used for the workshop is Gstat. Note that a basic knowledge of R is required to attend this workshop.





IRBV Microscopy Summer School


Tuesday 11 June 2013 - Thursday 13 June 2013,
A three-days intensive course in modern optical and fluorescence microscopy techniques with theory lectures and practical hands-on training This course is organized in collaboration with the company Zeiss. The course comprises lectures on brightfield optical microscopy and a variety of fluorescence-based imaging methods (see below for detailed program).





Basic steps for building a phylogenetic tree


Tuesday 02 July 2013 - Wednesday 03 July 2013, McGill, Stewart Biology Building
Target audience: Researchers and students who will have to build a phylogenetic tree for their project, but who have no or very little basic notions in phylogenetic analyses. Format: A workshop divided in two events. The first one consists in a 3 hours workshop including a 30 minutes lecture. Participants will have the chance to try a few methods for tree building, on data provided by the instructors. On the second event, optional, participants may bring their own data to try various phylogenetic analyses methods.





Stochasticité en biologie: la nature est-elle intrinsèquement aléatoire?


Monday 15 July 2013 - Saturday 20 July 2013,
Le but de l'école d'été est d'exposer à des jeunes chercheurs de disciplines variées incluant des biologistes, des bioinformaticiens et des biomathématiciens l'importance du hasard (ou des effets stochastiques) en biologie, aux niveaux moléculaire et cellulaire comme aux niveaux organismique et écologique.





Modelling Techniques in Ecology Summer School


Monday 26 August 2013 - Friday 30 August 2013, Saint-Gabriel
A one week summer school on modelling techniques of ecological ecosystems will be offered at August 26-30, 2013. Training will be given at the Domaine Valga, located at Saint-Gabriel (approx. 30 km from Rimouski). The summer school will be given by Dominique Gravel, professor at Université du Québec à Rimouski and holder of the Canada Research Chair in Continental Ecosystem Ecology. This intensive training session is principally intended for graduate students and postdocs in biology, forestry and marine sciences. The objective is to acquire the technical skills needed to design and analyze ecological models. Main topics will include: i) Differential equations, local stability analysis; ii) Numerical methods of integration; iii) Stochastic models; iv) Cellular automata and spatial ecology; v) Ecological networks.





Mathématiques pour une biodiversité en évolution


Monday 16 September 2013 - Friday 20 September 2013, Université de Montréal
Cet atelier portera sur les développements théoriques et méthodologiques récents permettant de modéliser la dynamique évolutive complexe responsable de la biodiversité actuelle. Des travaux récents à la frontière entre l'écologie et l'évolution seront présentés, ainsi que des applications à des données empiriques. Ces développements incluent de la modélisation mathématique et probabiliste, des méthodes statistiques, et des éclairages nouveaux obtenus à partir de données biologiques.





Les mathématiques de l'évolution des séquences : modèles biologiques et applications


Monday 23 September 2013 - Friday 27 September 2013,
Cet atelier abordera notamment : (a) les approches mathématiques et computationnelles les plus récentes pour le développement de modèles d'évolution du génome ou de séquences biologiques, (b) les études les plus récentes en biologie évolutive sur la façon que la sélection impose des contraintes et des dépendances sur les sites, et (c) l'emploi de tels modèles pour l'étude de la fonction ou de la structure de séquences biologiques.





Théorie de la coalescence : nouveaux développements et applications


Monday 07 October 2013 - Friday 11 October 2013,
La théorie de la coalescence est l'une des approches probabilistes parmi les plus élégantes et les plus puissantes en génétique des populations mathématique. Elle formalise l'approche rétrograde pour l'étude de l'évolution dans une population de taille finie mais très grande en considérant cette évolution sous l'effets de facteurs variés, étant donné l'observation d'un échantillon dans la génération courante, ce qui permet de faire le lien entre des modèles d'évolution et des données empiriques.





Biodiversité et environnement : perspectives de la théorie de la viabilité et des jeux dynamiques


Monday 04 November 2013 - Friday 08 November 2013,
Cet atelier a comme but de rassembler des experts en théorie de la viabilité, optimisation dynamique et théorie des jeux dynamiques intéressés par les questions environnementales et la biodiversité que ce soit d'un point de vue biologique, économique, social ou interdisciplinaire, et de favoriser la collaboration et l'échange d'information entre eux. Une large place sera faite à la modélisation mathématique de systèmes complexes avec une part d'incertitude, l'évolution de la coopération à travers les interactions entre individus ou espèces dans des jeux de bien commun, et les différents mécanismes d'adaptation et de survie.