Professionnel de recherche: Sébastien Rioux Paquette, PhD

Sebastien Rioux Paquette

Mon expérience de recherche en écologie et en biologie évolutive est relativement diversifiée. J’ai complété en 2008 un doctorat sur la conservation et la génétique des populations d’une espèce de tortue terrestre menacée d’extinction, endémique à Madagascar. Par la suite, j’ai obtenu une bourse postdoctorale pour travailler sur la génomique des populations de poissons marins en Nouvelle-Zélande. Plus récemment, j’ai complété un stage postdoctoral d’un an sur la modélisation de données provenant d’un projet à long terme sur le suivi du succès reproducteur de l’hirondelle bicolore en Estrie.

J’ai acquis une solide expérience sur le terrain, dans le laboratoire (séquençage d’ADN, génotypage, développement de marqueurs, etc), et pour l’analyse de données, incluant une large sélection de logiciels pour l’analyse de données génétiques et le language R. J’ai travaillé sur une grande variété d’espèces, et j’ai encore beaucoup de plaisir à découvrir de nouveaux systèmes et étudier de nouvelles problématiques. J’apprécie particulièrement travailler avec des étudiants, résoudre des problèmes reliés au travail de laboratoire et à l’analyse de données, et bâtir des projets collaboratifs. J’ai participé à la co-supervision et au mentorat de nombreux étudiants gradués, et contribué à plusieurs projets additionnels par l’intermédiaire de conseils et de révision à l’interne. J’aime réviser des articles et je peux founir des commentaires ou même fournir de l’aide pour la traduction de manuscripts.

Je suis actuellement le seul professionnel de recherche basé majoritairement à l’extérieur de Montréal (Université de Sherbrooke) mais je viens à Montréal à toutes les semaines et mon horaire est très flexible. N’hésitez pas à me contacter  (sebastien.rioux.paquette@usherbrooke.ca) pour toute assistance que je peux fournir avec (entre autres):

  • le travail de laboratoire (optimisation de PCR, séquençage d’ADN, génotypage, développement de microsatellites et de SNPs, séquençage de nouvelle génération, etc)
  • l’analyse de données génétiques (génétique des populations, phylogénétique, écologie moléculaire, etc)
  • modélisation écologique (GLMMs, model averaging, etc)
  • écriture de scripts R personnalisés
  • révision et traduction de manuscripts

Lorsque je ne contribue pas aux projets de recherche des membres du centre,  je contribue aux tâches visant à maintenir la cohésion entre ses membres et accroître les opportunités de collaborations, particulièrement pour les membres basés à Sherbrooke.

Publications récentes

  • Magnuson-Ford, K., Mooers, A., Rioux Paquette, S., and Steel, M. 2010. Comparing strategies to preserve evolutionary diversity. Journal of Theoretical Biology 266: 107-116.
  • Rioux Paquette, S., Louis Jr. E.E., and Lapointe, F.-J. 2010. Microsatellite analyses provide evidence of male-biased dispersal in radiated tortoises  Astrochelys radiata (Chelonia: Testudinidae). Journal of Heredity 101: 403-412.
  • Ruarus S., Rioux Paquette, S., Hale, K., and Ritchie P.A. 2011.  Genetic diversity and population viability in translocated North Island saddleback (Philesturnus rufusater) populations at Zealandia and Kapiti Island. New Zealand Journal of Ecology 35: 220-228.
  • Heeg, E.R., Rioux Paquette, S., Dedual, M., Abadia-Cardoso, A., M., Garza, J.C., and Ritchie, P.A. 2012 (in rev.) Tracing aquatic introductions and assessing the genetic changes from the source: a case study investigating the origins of New Zealand rainbow trout (Oncorhynchus mykiss). Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences.
  • Rioux Paquette, S., Engberg, S.E., Huebinger, R.M., and Louis Jr, E.E. 2012. Characterization of 13 novel microsatellite markers in the Galápagos  tortoise (Chelonoidis nigra). Conservation Genetics Resources.
  • Rioux Paquette, S., Garant, D., Pelletier, F., and Bélisle, M. 2012 (in rev.) Seasonal patterns in tree swallow prey (Diptera) abundance are affected by agricultural intensification. Ecological Applications.