Ateliers en biodiversité



Introduction à la géostatistique avec R


05:00 pm, mardi 21 mai 2013 - mardi 21 mai 2013, Édifice Stewart-Biology de l’Université McGill (local N4/17).
Cet atelier d’une durée de 4 heures offre une introduction aux méthodes géostatistiques avec R. Les méthodes géostatistiques offrent de nombreuses possibilités pour la caractérisation de la stucture spatiale des variables, la création de cartes continues à partir de données ponctuelles (interpolation), la simulation de patrons spatiaux, l’analyse spatiale multivariée, ainsi que la prise en compte de l’autocorrélation spatiale dans les tests statistiques. L’atelier sera divisé en sections pratiques intercalées de présentations orales de l’instructeur. Nous encourageons les participants à utiliser leur propre ordinateur portable, mais des ordinateurs seront aussi disponibles sur place. Notez qu’une connaissance de base de R est nécessaire pour participer à cet atelier.





Introduction to geostatistics with R


05:00 pm, mardi 28 mai 2013 - mardi 28 mai 2013, Stewart-Biology building, McGill University (room N4/17).
This 4-hour workshop offers an introduction to geostatistical methods with R. Geostatistics offer numerous possibilities to characterize the spatial structure of variables, to create continous maps from point data (interpolation), to simulate spatial patterns, for multivariate analysis and for correcting for the effect of autocorrelation in statistical tests. This workshop will be divided in practical sections and oral presentations by the instructor. Participants are encouraged to use their own laptops but computers will be available on the site with the R software. The main R package used for the workshop is Gstat. Note that a basic knowledge of R is required to attend this workshop.





IRBV Microscopy Summer School


mardi 11 juin 2013 - jeudi 13 juin 2013,
A three-days intensive course in modern optical and fluorescence microscopy techniques with theory lectures and practical hands-on training This course is organized in collaboration with the company Zeiss. The course comprises lectures on brightfield optical microscopy and a variety of fluorescence-based imaging methods (see below for detailed program).





Notions de bases pour construire un arbre phylogénétique


mardi 02 juillet 2013 - mercredi 03 juillet 2013, McGill, Stewart Biology Building
Public cible: Chercheurs et étudiants en biologie qui devront faire des analyses phylogénétiques pour leur projet, mais qui n’ont pas ou très peu de notions de base. Format: Un atelier en deux volets. Le premier volet consiste en un atelier de 3 heures, débutant par une présentation de 30 minutes. Les participants auront la chance d’essayer quelques méthodes d’analyses phylogénétiques sur des données fournies par les instructeurs. Le second volet, optionel, permettra aux participants de tester différentes méthodes de reconstruction d’arbres avec leur propre données.





Stochasticité en biologie: la nature est-elle intrinsèquement aléatoire?


Lundi 15 juillet 2013 - samedi 20 juillet 2013,
Le but de l'école d'été est d'exposer à des jeunes chercheurs de disciplines variées incluant des biologistes, des bioinformaticiens et des biomathématiciens l'importance du hasard (ou des effets stochastiques) en biologie, aux niveaux moléculaire et cellulaire comme aux niveaux organismique et écologique.





École d'été sur les techniques de modélisation en écologie


Lundi 26 août 2013 - vendredi 30 août 2013, Saint-Gabriel
Une école d’été d’une durée d’une semaine portant sur les Techniques de modélisation des systèmes écologiques sera offerte du 26 au 30 août 2013. Cette formation sera donnée par Dominique Gravel, professeur à l’Université du Québec à Rimouski et se tiendra au Domaine Valga, situé à Saint-Gabriel (environ 30 km de Rimouski). Les thèmes abordés seront les suivants : i) Équations différentielles, systèmes à l'équilibre, analyse de stabilité locale; ii) Méthodes numériques d'intégration; iii) Modèles stochastiques; iv) Automates cellulaires et écologie spatiale; v) Réseaux écologiques. Cette formation est organisée par le programme FONCER en Modélisation de la complexité de la forêt.





Mathématiques pour une biodiversité en évolution


Lundi 16 septembre 2013 - vendredi 20 septembre 2013, Université de Montréal
Cet atelier portera sur les développements théoriques et méthodologiques récents permettant de modéliser la dynamique évolutive complexe responsable de la biodiversité actuelle. Des travaux récents à la frontière entre l'écologie et l'évolution seront présentés, ainsi que des applications à des données empiriques. Ces développements incluent de la modélisation mathématique et probabiliste, des méthodes statistiques, et des éclairages nouveaux obtenus à partir de données biologiques.





Les mathématiques de l'évolution des séquences : modèles biologiques et applications


Lundi 23 septembre 2013 - vendredi 27 septembre 2013,
Cet atelier abordera notamment : (a) les approches mathématiques et computationnelles les plus récentes pour le développement de modèles d'évolution du génome ou de séquences biologiques, (b) les études les plus récentes en biologie évolutive sur la façon que la sélection impose des contraintes et des dépendances sur les sites, et (c) l'emploi de tels modèles pour l'étude de la fonction ou de la structure de séquences biologiques.





Théorie de la coalescence : nouveaux développements et applications


Lundi 07 octobre 2013 - vendredi 11 octobre 2013,
La théorie de la coalescence est l'une des approches probabilistes parmi les plus élégantes et les plus puissantes en génétique des populations mathématique. Elle formalise l'approche rétrograde pour l'étude de l'évolution dans une population de taille finie mais très grande en considérant cette évolution sous l'effets de facteurs variés, étant donné l'observation d'un échantillon dans la génération courante, ce qui permet de faire le lien entre des modèles d'évolution et des données empiriques.





Biodiversité et environnement : perspectives de la théorie de la viabilité et des jeux dynamiques


Lundi 04 novembre 2013 - vendredi 08 novembre 2013,
Cet atelier a comme but de rassembler des experts en théorie de la viabilité, optimisation dynamique et théorie des jeux dynamiques intéressés par les questions environnementales et la biodiversité que ce soit d'un point de vue biologique, économique, social ou interdisciplinaire, et de favoriser la collaboration et l'échange d'information entre eux. Une large place sera faite à la modélisation mathématique de systèmes complexes avec une part d'incertitude, l'évolution de la coopération à travers les interactions entre individus ou espèces dans des jeux de bien commun, et les différents mécanismes d'adaptation et de survie.